Podrás utilizar tu certificado las veces que quieras mientras se encuentre vigente, una vez expirado deberás comprar uno nuevo para seguir firmando documentos. Puedes revisar la vigencia de tu certificado en el siguiente enlace: https://asistencia.acepta.com/buscar-certificado.html
Lo habitual es que los clientes facturen sin tener alguna limitación respecto a la cantidad de documentos, pero en caso de que tengas folios limitados, debes consultar directamente con el SII para que te puedan entregar la asistencia.